Organikaj kaj neorganikaj pigmentoj estas distingitaj surbaze de sia origino kaj kemiaj trajtoj.
Fonto: Organikaj pigmentoj estas ĉerpitaj aŭ sintezitaj de bestoj, plantoj, mineraloj aŭ artefarite sintezitaj organikaj komponaĵoj. Neorganikaj pigmentoj estas ĉerpitaj aŭ sintezitaj el ercoj, mineraloj aŭ sintezaj neorganikaj komponaĵoj.
Kemiaj propraĵoj: La molekuloj de organikaj pigmentoj estas kutime kunmetitaj de kompleksaj strukturoj enhavantaj karbonon, kaj ilia koloro estas determinita de la kemia strukturo de la organika komponaĵo. La molekuloj de neorganikaj pigmentoj estas kutime kunmetitaj de neorganikaj elementoj, kaj ilia koloro estas determinita de la trajtoj kaj strukturo de la elementoj.
Stabileco: Neorganikaj pigmentoj estas ĝenerale pli stabilaj ol organikaj pigmentoj kaj pli rezistemaj al lumo, acido, alkala kaj varmo. Organikaj pigmentoj povas rompiĝi aŭ ŝanĝi koloron sub certaj kondiĉoj. Kolora gamo: Pro diferencoj en sia kemia strukturo, organikaj pigmentoj ĝenerale havas pli larĝan kolorgamon, ebligante pli viglajn kolorojn. Neorganikaj pigmentoj havas relative mallarĝan gamon da koloroj. Aplikaj kampoj: Organikaj pigmentoj taŭgas por tinkturfarboj, farboj, plastoj, papero kaj aliaj kampoj. Neorganikaj pigmentoj estas vaste uzataj en ceramikaĵo, vitro, pigmentoj, tegaĵoj kaj aliaj kampoj.

Oni devas rimarki, ke ambaŭ organikaj kaj neorganikaj pigmentoj havas siajn proprajn avantaĝojn kaj karakterizaĵojn, kaj la elekto de kiu pigmento uzi dependas de la specifaj aplikaj bezonoj kaj la dezirata efiko.